Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB4P16144 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms