Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA4P13612 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA4P13612 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms