Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BMP3P12645 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BMP3P12645 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms