Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FCER1AP12319 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCER1AP12319 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms