Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD28P10747 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD28P10747 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD28P10747 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms