Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms