Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGPD1P0DJD0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGPD1P0DJD0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms