Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC172P0C7W6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms