Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4AP0C0L4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C4AP0C0L4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms