Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRCP08575 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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