Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSP90AB1P08238 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSP90AB1P08238 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms