Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMBP08118 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMBP08118 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMBP08118 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMBP08118 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MSMBP08118 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MSMBP08118 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MSMBP08118 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSMBP08118 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSMBP08118 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms