Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF1RP07333 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms