Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DOAP06340 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms