Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYBBP04839 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYBBP04839 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms