Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR1AO95602 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR1AO95602 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms