Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETM1O95202 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETM1O95202 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETM1O95202 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETM1O95202 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETM1O95202 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LETM1O95202 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETM1O95202 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETM1O95202 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETM1O95202 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms