Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UFL1O94874 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UFL1O94874 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms