Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KA4O75676 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA4O75676 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms