Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIN3BO75182 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIN3BO75182 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms