Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNND1O60716 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND1O60716 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms