Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms