Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms