Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NDUFS5O43920 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms