Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms