Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms