Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA3O43365 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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