Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTSS1O43312 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTSS1O43312 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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