Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRXO43186 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRXO43186 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRXO43186 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRXO43186 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRXO43186 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRXO43186 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms