Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6AO15550 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6AO15550 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms