Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARPC5O15511 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms