Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FANCAO15360 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FANCAO15360 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FANCAO15360 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FANCAO15360 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FANCAO15360 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FANCAO15360 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
FANCAO15360 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FANCAO15360 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FANCAO15360 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms