Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPATO15228 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPATO15228 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPATO15228 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPATO15228 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms