Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBDO15205 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBDO15205 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBDO15205 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBDO15205 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms