Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms