Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP290O15078 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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CEP290O15078 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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CEP290O15078 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEP290O15078 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CEP290O15078 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CEP290O15078 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CEP290O15078 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CEP290O15078 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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