Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RGPD8O14715 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RGPD8O14715 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms