Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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