Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms