Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATL2C9JE40 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms