Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DXG7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DXG7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DXG7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms