Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POTEFA5A3E0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms