Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F8A0AVK6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms