Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms