Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms