Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTF1AQ7RTS3 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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