Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DUX4L9Q6RFH8 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms