Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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