Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms