Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-2B6SEH9 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms